Endosperm genotyping as a strategy to differentiate the allele source in maize heterozygous progeny

The objective of this work was to distinguish the parental source of alleles in heterozygous progeny using semiquantitative polymerase chain reaction (PCR) in maize endosperm. Endosperms derived from direct and reciprocal single-cross hybrids between maize inbred lines L3 and L1113-01 were genotyped...

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Published in:Pesquisa agropecuaria brasileira 2009-10, Vol.44 (10), p.1291-1296
Main Authors: Martins, Francielle Alline(Universidade Federal de Viçosa Departamento de Biologia Geral), Carneiro, Pedro Crescêncio Souza(Universidade Federal de Viçosa Departamento de Biologia Geral), Cruz, Cosme Damião(Universidade Federal de Viçosa Departamento de Biologia Geral), Carneiro, José Eustáquio de Souza(UFV Departamento de Fitotecnia), Guimarães, Claudia Teixeira(Embrapa Milho e Sorgo)
Format: Article
Language:eng ; por
Subjects:
AGRICULTURE, DAIRY & ANIMAL SCIENCE
AGRICULTURE, MULTIDISCIPLINARY
allelic origin
heterozigoto
heterozygote
natural populations
origem alélica
PCR semiquantitativa
poligenes
polygenes
populações naturais
semiquantitative PCR
Zea mays
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Description
Summary:The objective of this work was to distinguish the parental source of alleles in heterozygous progeny using semiquantitative polymerase chain reaction (PCR) in maize endosperm. Endosperms derived from direct and reciprocal single-cross hybrids between maize inbred lines L3 and L1113-01 were genotyped by semiquantitative PCR methodology (SQ-PCR) using fluorescent microsatellite primers. The amplification products were evaluated by the ratios of fluorescence intensity (RFI), calculated between the peaks corresponding to the alleles derived from each parental line. Based on the statistically significant contrast between RFI mean values of direct and reciprocal single-cross hybrids, it was possible to distinguish the number of alleles received from each parental line and, ultimately, to determine the origin of the alleles of each cross. Thus, endosperm genotyping using SQ-PCR is a promising strategy to map QTL in maize outbred populations. O objetivo deste trabalho foi distinguir a origem de alelos em progênies heterozigóticas usando reação em cadeia da polimerase (PCR) semiquantitativa em endosperma de milho. Endospermas derivados de híbridos simples diretos e recíprocos entre as linhagens de milho L3 e L1113-01 foram genotipados pela metodologia de PCR semiquantitativa (PCR-SQ) com uso de primers microssatélites fluorescentes. Os produtos de amplificação foram avaliados por meio da razão de intensidade de fluorescência (RIF), calculada entre os valores de intensidade dos picos correspondentes aos alelos derivados de cada genitor. Com base no contraste estatisticamente significativo dos valores médios das RIF entre os híbridos simples direto e recíproco, foi possível distinguir o número de alelos recebidos de cada genitor e, finalmente, determinar a origem dos alelos de cada híbrido. Assim, a genotipagem de endosperma utilizando PCR-SQ é uma estratégia promissora no mapeamento de QTLs em populações exogâmicas de milho.
ISSN:0100-204X
1678-3921
1678-3921
0100-204X
DOI:10.1590/S0100-204X2009001000012