Presence of double-stranded RNA in Heterobasidion annosum

A search for double‐stranded RNA (dsRNA) was conducted among 204 European isolates of the pathogenic fungus Heterobasidion annosum. Nucleic acids were extracted and purified by cellulose CF‐11 chromatography or lithium chloride precipitation. dsRNA was present in eight of the isolates and was confir...

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Published in:Forest pathology = Journal de pathologie forestière = Zeitschrift für Forstpathologie 2001-12, Vol.31 (6), p.387-394
Main Authors: Ihrmark, K., Zheng, J., Stenström, E., Stenlid, J.
Format: Article
Language:English
Subjects:
Biological and medical sciences
Biological control
Control
Fundamental and applied biological sciences. Psychology
Fungal plant pathogens
Heterobasidion annosum
Microbiology
Phytopathology. Animal pests. Plant and forest protection
Replicative cycle, interference, host-virus relations, pathogenicity, miscellaneous strains
Variation, races, biotypes, parasitic specialization, genetics
Virology
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Description
Summary:A search for double‐stranded RNA (dsRNA) was conducted among 204 European isolates of the pathogenic fungus Heterobasidion annosum. Nucleic acids were extracted and purified by cellulose CF‐11 chromatography or lithium chloride precipitation. dsRNA was present in eight of the isolates and was confirmed by nuclease digestion. The dsRNA elements ranged between 1.8 and 2.4 kbp and were found in two H. annosum intersterility groups, S and P. Partial amino acid sequence information from one dsRNA element showed significant homology to RNA‐dependent RNA polymerases from several fungal partitiviruses. This is the first report of the presence of dsRNAs in H. annosum. Possible implications of dsRNA for the biology of the fungus and the potential for biological control are discussed. Présence d’ARN bicaténaires chez Heterobasidion annosum La présence d’ARN bicaténaires (ARNbc) a été recherchée chez 204 isolats européens du champignon pathogène Heterobasidion annosum. Les acides nucléiques ont été extraits et purifiés par chromatographie sur cellulose CF‐11 ou par précipitation au chlorure de lithium. Des ARNbc étaient présents chez huit isolats et ont été confirmés par une digestion à la nucléase. Des ARNbc dont la taille variait de 1,8 à 2,4 kpb ont été trouvés dans les deux groupes d’interstérilité S et P. Des informations partielles sur la séquence protéique d’un ARNbc montraient une homologie significative avec des ARN polymérases ARN‐dépendantes de plusieurs partitivirus fongiques. C’est la première mention de la présence d’ARN bicaténaires chez H. annosum. Les implications possibles pour la biologie du champignon et pour la lutte biologique potentielle sont discutées. Doppelstrang‐RNA in Heterobasidion annosum 204 europäische Isolate des pathogenen Pilzes Heterobasidion annosum wurden auf eine Infektion mit Doppelstrang‐RNA (dsRNA) untersucht. Nukleinsäuren wurden mittels Zellulose‐Chromatographie oder mit Hilfe einer Lithiumchlorid‐Fällung extrahiert und gereinigt. Doppelstrang‐RNA konnte in acht Isolaten nachgewiesen werden. Die dsRNA Fragmente waren zwischen 1.8 und 2.4 kbp lang und waren in Vertretern der Intersterilitätsgruppen P und S vorhanden. Die aus der partiellen Sequenzierung eines der dsRNA‐Fragmente abgeleitete Aminosäuresequenz zeigte starke Homologien zu RNA‐abhängigen RNA‐Polymerasen diverser pilzlicher Partitiviren. Es handelt sich um den Erstnachweis von dsRNA in H. annosum. Die möglichen Konsequenzen einer dsRNA‐Infektion auf die Biologie d
ISSN:1437-4781
1439-0329
DOI:10.1046/j.1439-0329.2001.00263.x